Les théories de la biodiversité sont à l'interface entre l'écologie et l'évolution.

Les processus qui interviennent dans la genèse et le maintien de la biodiversité sont présentés. Ces processus sont de nature génétique (sélection naturelle, mutation, dérive, systèmes de reproduction), macroévolutive (spéciation, extinction), et écologique (maintien du polymorphisme, structuration biogéographique, niche écologiques).

Ces concepts sont abordés sous forme de modèles simples qui font intervenir la théorie des jeux, la génétique des populations et la dynamique des populations, mais aussi à l'aide d'étude de cas particuliers.